In der Diepholzer Moor-Niederung sind grundwassernahe humusreiche Böden (Hoch- und Niedermoore) verbreitet. Die Naturräume Mittleres- und Verdener-Weser-Tal grenzen das Gebiet Mittlere Weser nach Osten ab. Hier dominieren vorwiegend schluffig-tonige Auenablagerungen.
Die GW-Körper im Beratungsgebiet Mittlere Weser sind durch eine geringe hydrogeologische Schutzfunktion gekennzeichnet, so dass Stoff-Einträge aus der landwirtschaftlichen Flächenbewirtschaftung auch im Grundwasser gemessen werden. Gründe hierfür sind:
- lückenhafte geringdurchlässige Deck- und Trennschichten (Geschiebelehm, Beckentone),
- flache GW-Körper mit nur 20 bis 50 m Mächtigkeit,
- hohes N-Freisetzungspotenzial aus (entwässerten) Niedermooren.